La zona que actualmente ocupa el municipio de Mazcuerras estuvo habitada desde el Paleolítico Superior, como evidencia el hallazgo de material lítico en un yacimiento de Ibio.
Se cree que en la época prerromana vivió en la zona la gens cántabra de los blendios. Durante la época de la dominación romana, aunque la principal vía de comunicación era la calzada por el valle del Besaya, se cree que esta zona era una ruta alternativa.
Un documento de 814 hace una referencia a "Malacoria", como lugar del que procedían foramontanos, esto es, repobladores de Castilla. En la Edad Media, este territorio formaba parte del alfoz de Cabezón, dentro de la merindad de las Asturias de Santillana. En el libro Becerro de las Behetrías de Castilla varios concejos que hoy están integrados en este municipio aparecían formando parte del distrito valle de Cabezón: Cos, la colación de Ibio con los barrios de Ferrera, Meñi, Serna, Sierra y Viya, y Mazcuerras con los barrios de Cohíño y Villanueva.
La Casa de la Vega extendió su dominio señorial sobre estos territorios en el siglo XIV, confirmándolo el rey Juan II en 1444 en la persona de Íñigo López de Mendoza. Cabezón fue uno de los valles que emprendió el Pleito de los Valles para eludir el dominio señorial. Concluyó en 1581, con el reconocimiento del realengo en estas zonas.
Este territorio estaba integrado en la provincia de los Nueve Valles (1630). En 1821 Cos, Ibio y Mazcuerras formaron uno de los tres municipios constituidos en el valle de Cabezón. Mazcuerras perteneció al partido judicial de Comillas, más tarde pasó a Valle de Cabuérniga y, finalmente, a Torrelavega, en el que permanece
Historia En el pasado, Santibáñez
formó con Carrejo un solo lugar. Santibáñez-Carrejo aparecía como una de las
ocho aldeas que formaban el distrito administrativo del valle de Cabezón,
dentro de la merindad de Asturias de Santillana, en el Becerro de las Behetrías
de 1352. Durante el Trienio Constitucional (1820-1823), Santibáñez-Carrejo,
junto a Ontoria-Vernejo y Cabezón constituyeron el municipio de Cabezón de la
Sal. [editar] Monumentos Carrejo es un hermoso núcleo urbano, lleno de casonas
interesantes. Además, en su parque hay interesantes especies arbóreas. El
elemento más destacado de su patrimonio es el Palacio de Ygareda, o Gómez de la
Torre, o Igareda y Balbás, o Casa-Palacio de los Haces, declarada Monumento
Histórico Artístico el 20 de diciembre de 1984. Actualmente este edificio es el
"Museo Regional de la Naturaleza". Está datado en torno a 1720. Tiene
planta rectangular y tejado a dos aguas. Está construido en piedra de sillería.
La fachada, orientada al sur, tiene una hilera de cinco arcos de medio punto.
Encima hay una solana o balcón corrido. En el hastial o cortavientos puede
verse el escudo de los Cos y Cayón. Tiene adosada por su parte occidental la
capilla, con un tejado rematado por bolas en las esquinas. Actualmente es Museo
de la Naturaleza
